ASIA
Plateforme approches fonctionnelles et structurales des interactions cellulaires
Cliquez ici pour accéder au calendrier de réservation en ligne (Nouveaux utilisateurs veuillez contacter la responsable fonctionnelle).
Présentation
La plateforme technologique ASIA « Approches fonctionnelles et Structurales des InterActions
cellulaires », localisée à la Faculté des Sciences et Technologies, a
pour objectif de rendre accessibles des ressources technologiques
permettant l’étude de la régulation des activités biologiques et
physiologiques des protéines. Les outils disponibles sur la plateforme
permettent d’aborder cette étude à différents niveaux.
Trouvez l’outil qu’il vous faut !
Domaines d’applications des technologies disponibles sur la plateforme ASIA
La plateforme ASIA donne aujourd’hui accès à différents équipements
et moyens humains destinés à offrir à une communauté d’utilisateurs des
ressources technologiques de haut niveau.
Rattachée au Pôle Scientifique A2F, la plateforme ASIA est ouverte,
et en libre accès à tout utilisateur quel que soit leur rattachement
(organismes publics, entreprises…).
Equipements
- DRX “SwitchSENSE”
- UHPLC-MS-DAD
- SEC-MALS-RI
- ITC
- ÄKTA pure
- Lyophilisateur (Benchtop)
- Broyeur cryogénique (Cryomill)
- Concentrateur sous vide (mivac)
- Flash Chromatographie
- Distillateurs automatiques (Soxtherm)
- Ultracentrifugeuse
- Fibrebag
- qPCR
- Lecteur de microplaques (Ensight)
- Néphélomètre (Néphélostar +)
Coordonnées
Responsable opérationnel : Jean-Michel GIRARDET
jean-michel.girardet@univ-lorraine.fr
Responsable fonctionnelle : Emilie ROBERT
emilie.robert@univ-lorraine.fr
Téléphone : 03.72.74.51.66
Site web de la plateforme : https://a2f.univ-lorraine.fr/asia/
Plateforme ASIA
Faculté des Sciences et Technologies
Campus Aiguillettes
BP 70239
54506 Vandœuvre-lès-Nancy Cedex
ASIA est située à l’entrée 1B de la FST, au niveau 6
BioDA
Plateforme Biodisponibilité Bioactivité
La Plateforme Biodisponibilité Bioactivité (Bio-DA) a pour objectif de fournir des services permettant la caractérisation de la biodisponibilité ou de la bioactivité de molécules de diverses natures. Celles-ci peuvent avoir un effet positif comme négatif sur les cibles biologiques proposées par la plateforme.
Dans le cadre de la démarche qualité du programme INFRA+ de l’I-SITE Lorraine Université d’Excellence (LUE), Bio-DA est en cours d’évaluation afin d’être labellisée StAR LUE. ***. Sa politique qualité est disponible ici: [Politique Qualité de la plateforme].
La plateforme est ouverte aux demandes émanant de laboratoires de recherche ou d’entreprises sous la forme de collaboration scientifique ou de prestation.
Présentation :
La plateforme Bio-DA, située sur le site de l’ENSAIA propose des équipements, savoir-faire et modèlesin vitro,ex vivoetin vivode pointe dans les thématiques de biodisponibilité et bioactivité. Elle collabore ainsi à de nombreux projets scientifiques dans ces domaines.
La Plateforme répond aux exigences techniques et réglementaires applicables aux établissements utilisateurs d’animaux à des fins scientifiques et nécessaires à la mise en place d’expérimentations pour les études de biodisponibilité et de bioactivité. Les structures expérimentales concernées sont agréées pour ces activités.
La diversité des modèles animaux et les équipements présents sur la plateforme permettant des approches multi-échelles : in vitro, in vivo ou in silico offrent la possibilité de réaliser de nombreuses expérimentations dans divers domaines de compétences tels que :
- Les modèles microfluidiques d’organes
- Les cultures de lignées cellulaires (intestinales, neurales),
- Les cultures primaires de cellules du système nerveux centrales
- L’imagerie tissulaire et cellulaire
- Tests in vitro de disponibilité environnementale
- Test in vitro de bioaccessibilité
- La biodisponibilité relative,
- La biodisponibilité absolue et la toxicocinétique
Équipements de la plateforme : financement A2F – UL – UR AFPA– LIBio – AGROVALOR
- Une salle dédiée aux modèles microfluidiques d’organes
- Deux salles de cultures cellulaires (culture de lignées cellulaires (CaCO2, HT29X, etc) et culture primaire de cellules neuronales)
- Une salle d’imagerie (cryostat, microscopes et à dissection à laser)
- Une salle technique avec appareillage de préparation d’échantillon (lyophilisateurs, broyeurs…)
- Des salles dédiés à la gestion et conservation des échantillons.
Accueil de chercheurs et de formations :
Dans le cadre des projets de recherche, chaque année des étudiants (de la L1 au doctorant) sont accueillis au sein de la plateforme, ainsi que des partenaires chercheurs.
Transferts de technologie vers les professionnels :
Les travaux de validation in vivo d’un test de bioaccessibilité (Denys et al., 2012 publiés dans EST) pour 3 éléments traces métalliques du sol (As, Cd, Pb) conduits sur de la plateforme Bio-DA ont fait l’objet d’une normalisation ISO : Test ISO 17924 :2018 : Soil quality- Assessment of human exposure from ingestion of soil and soil material- Procedure for the estimation of the human bioaccessibility/bioavailability of the metals in soi. (https://www.iso.org/standard/64938.html)
Coordonnées
Agnès Fournier, Directrice scientifique de la plateforme Bio-DA
Claire Soligot, Directrice opérationnel de la plateforme Bio-DA
bioda-dir@univ-lorraine.fr ; Tél. 03.72.74.41.68.
Site web de la plateforme : https://www.urafpa.fr/index.php/plateforme/technique/3
Plateforme Biodisponibilité Bioactivité (Bio-DA) – ENSAIA – 2 avenue de la Forêt de Haye – 54500 VANDOEUVRE-LES-NANCY
Plateforme P3 mycologie
Plateforme P3 mycologie
Présentation
La plateforme P3 mycologie est hébergée par l’unité de mycologie ANSES laboratoire de la santé des végétaux. Cette unité est une unité sous contrat INRAE (USC 1480). Cette plateforme permet de détenir et manipuler les champignons et oomycètes phytopathogènes qui sont listés comme organismes de quarantaine pour l’Union Européenne (Règlement UE 2016-2031). Il s’agit d’une salle confinée de 25 m2 dont l’atmosphère, ainsi que les effluents liquides et solides sont traités pour garantir une absence de contamination de l’environnement extérieur. Des équipements et des procédures de travail spécifiques sont en place pour prévenir tout échappement de ces parasites fongiques réglementés. Cette plateforme fait l’objet un contrôle permanent et est détentrice d’un agrément préfectoral renouvelable tous les 5 ans. Elle est équipée de tout l’équipement permettant de réaliser des manipulations microbiologiques et de biologie moléculaire. Cette plateforme permet à l’Anses de mener à bien ses travaux de recherche sur ces parasites, normalement interdits de détention et de manipulation dans l’UE et en France.
Coordonnées
Responsable des installations :
- Renaud IOOS (renaud.ioos@anses.fr)
- Jaime AGUAYO (jaime.aguayo@anses.fr)
Tel : 03 83 29 00 02
Sites web de la plateforme :
ANSES LSV, unité de mycologie
Domaine de Pixérécourt, Bâtiment E
54220 Malzéville
PASM
Plateforme d'analyse structurale et métabolomique
Présentation
La plateforme PASM est affiliée :
– au réseau scientifique ProteinLorraine
– au club Grand-Est de l’Association Francophone des Sciences Séparatives (AFSEP)
– à l’Université de la Grande Région (UniGR)
– au Réseau Français de Métabolomique et de Fluxomique (RFMF)
Elle met à disposition de la recherche académique des équipements performants pour l’analyse des biomolécules ainsi que des solutions pour la préparation et la purification des échantillons.
La plateforme PASM procure aux laboratoires une expertise technique et scientifique dans le domaine de l’analyse par spectrométrie de masse : étude structurale par filiation LC-MSn, dosage à haute sensibilité par LC-MS/MS et GC-MS/MS, identification d’inconnus par LC-MS haute résolution ou GC-EI, discrimination d’isobares par LC-MS haute résolution, analyse de mélanges gazeux par GC-MS, étude des protéines par LC-MS, caractérisation de polymères et microorganismes par MALDI-ToF…
Une large gamme de biomolécules d’origines diverses (végétale, animale, microbienne) peut donc être étudiée de façon qualitative et/ou quantitative.
A titre d’exemples, il est possible de :
– identifier/doser des métabolites primaires (acides aminés, sucres simples et acides organiques)– caractériser/doser des métabolites secondaires (phénols, terpénoides, alcaloïdes…)
– caractériser/doser des antibiotiques (stambomycines, kinamycines, polycétides…)
– caractériser/doser des lipides polaires et apolaires (phospholipides, TAG, stérols)
– caractériser des protéines entières (protéines laitières, enzymes, anticorps monoclonaux…)
– caractériser/doser des peptides (hydrolysats protéiques, extraits végétaux/bactériens/animaux)
– caractériser des biomolécules hybrides (peptides acylés, composés phénoliques acylés)
– caractériser des produits d’oxydation (issus de composés phénoliques notamment)
– cribler des chélateurs de métaux (hydrolysats protéiques, extraits végétaux ou bactériens)
– caractériser des complexes de coordination (peptide métal,ferrosidérophore…)
– caractériser des polymères et biopolymères (protéines, polysaccharides, plastiques)
– identifier/doser des ions organiques et minéraux (Na+, K+, Ca2+, Mg2+, NH4+, X-, NO3-, SO42-, PO43-…)
– caractériser des microorganismes (bactéries, champignons, levures)
– réaliser des analyses de métabolomique non-ciblée pour étudier la réponse à différents stress (plantes…)
– doser des micropolluants à haute sensibilité (PCB, chlordécone, HCH, DDT…)
Équipements
Analyse structurale et quantitative
- UHPLC-HRMS/MS « Orbitrap ID-X » orbitrap et trappe ionique (ThermoScientific)
- UHPLC-MS/MS « LTQ » trappe ionique (ThermoScientific)
- UHPLC-MS simple quadripôle (Shimadzu)
- UHPLC-PDA-FLUO (Shimadzu)
- HPLC/IC-EC-MS (Metrohm, Waters)
- GC-MS simple quadripôle (Agilent)
- GC-MS/MS triple quadripôle (ThermoScientific)
- Maldi-ToF/ToF (Shimadzu)
- LC flash (Grace)
- HPLC semi-préparative (Gilson)
- ASE ou système d’extraction accélérée par solvant (ThermoScientific)
- Automate SPE ou automate d’extraction en phase solide (Gerstel)
- Ultracentrifugeuse 100000G (ThermoScientific)
- HPLC nanospotter pour préparation automatisée des dépôts Maldi (Shimadzu)
- Lyophilisateur pilote 6 kg glace/24 h (Cryotec)
Coordonnées
Responsable scientifique et opérationnel : Cédric PARIS
Cedric.paris@univ-lorraine.fr
Site web de la plateforme : http://ensaia.univ-lorraine.fr/fr/content/plateau-danalyse-structurale-et-metabolomique
ENSAIA
2 avenue de la Forêt de Haye
BP 20163
54505 Vandoeuvre-lès-Nancy
PEA
Plateforme Expérimentale en Aquaculture
La Plateforme Expérimentale en Aquaculture (PEA) est le siège des activités du groupe projet « Domestication en Aquaculture Continentale (DAC) » de l’Unité de Recherche « Animal et Fonctionnalités des Produits Animaux » (UR AFPA).
Dans le cadre de la démarche qualité du programme INFRA+ de l’I-SITE Lorraine Université d’Excellence (LUE), la PEA a été une des 10 premières infrastructures de recherche labellisée StAR LUE en 2019 avec le niveau maximal de reconnaissance (3 étoiles).
La création de la PEA a permis l’intégration de l’UR AFPA dans le réseau européen AQUAEXCEL 2020 (2015-2020), puis AQUAEXCEL3.0 (2020-2025). Ce réseau mutualise les infrastructures de recherche aquacoles européennes les plus performantes (22 partenaires, 13 pays), couvrant les systèmes de production, espèces de poissons et champs disciplinaires majeurs du secteur de l’aquaculture.
La plateforme est ouverte à toute demande de collaboration de la part de laboratoires de recherche ou d’entreprises. Ces dernières années, des chercheurs étrangers (belges, hongrois, polonais, tchèques) ont accédé à nos infrastructures pour mener des recherches.
Présentation
Pour mener à bien ses recherches, le groupe projet DAC mobilise, depuis avril 2014, la Plateforme Expérimentale en Aquaculture (PEA) d’une superficie de 800 m² sur le site de la Faculté des Sciences et Technologies (FST) de Vandœuvre-lès-Nancy (54500 France).
La Plateforme répond aux exigences techniques et réglementaires applicables aux établissements utilisateurs d’animaux à des fins scientifiques et nécessaires à la mise en place d’expérimentations pour développer les connaissances sur la domestication de nouvelles espèces de poisson d’eau douce (ex : perche commune, sandre) en circuit fermé. Elle est agréée par la Direction Départementale de la Protection des Populations (numéro d’agrément D54-547-18).
La richesse des espèces, des stades de vie et des traits biologiques potentiellement étudiés offre la possibilité de réaliser de nombreuses expérimentations dans divers domaines tels que la nutrition, la croissance, le bien-être, la génétique des poissons ou la mixité des espèces piscicoles en élevage (sandre, esturgeon, tanche, black-bass) et permet de répondre aux nombreuses interrogations émanant de la profession.
Équipements de la plateforme
(3.2 M euros TTC, financements FEDER – Université de Lorraine – UR AFPA – Conseil Régional de Lorraine)
- Des locaux techniques (200 m2) comprenant tous les équipements de génie climatique (groupes de régulation thermique, centrale de traitement d’air, surpresseurs et chaudières).
- 16 salles indépendantes et identiques de 10 m2 appelées écotrons (figure 1) avec chacune un bassin d’élevage (volume utile de 2 m3) fonctionnant en circuit fermé. Un éclairage de type LED permet de simuler l’aube et le crépuscule pour répondre aux travaux de recherche actuels. Ces écotrons permettent la mise en œuvre d’approches multifactorielles.
- Une salle d’acclimatation contenant 6 bassins de 1700 litres.
- Une écloserie (figure 2) dotée de 2 tables d’incubation (environ 60 clayettes chacune).
- Une station d’élevage larvaire (figure 3) composée de 10 bacs de 700 litres en circuit fermé.
- Une salle d’élevage de proies vivantes.
- Une salle d’élevage Zebrafish (figure 4), constituée de 3 batteries d’élevage complètement autonomes, avec une capacité d’accueil de 5000 individus adultes.
- Un laboratoire dédié aux analyses physico-chimiques de l’eau et autres prélèvements expérimentaux.
- Un poste informatique pour la Gestion Technique Centralisée permettant le pilotage des paramètres environnementaux et la surveillance à distance du fonctionnement de la structure pour une sécurisation optimale des animaux et la bonne conduite des protocoles expérimentaux.
L’équipement couplé à la GTC permet une maitrise très fine des facteurs clés pour la réussite de la reproduction des poissons que sont la température (régulation ±0,1°C) et la lumière (régulation de la photopériode et de l’intensité lumineuse ±1 lux). Tous ces paramètres peuvent ainsi être programmés de manière individuelle sur l’ensemble des 20 salles qui constituent cette plateforme.
- La PEA possède également une annexe, dans un bâtiment voisin, constituée de 2 salles. L’une, thermo-régulée est occupée par 5 mini-écloseries programmable individuellement et l’autre dédiée à l’étude du comportement des poissons (larves ou juvéniles).
Accueil de chercheurs et de formations
Dans le cadre du réseau Européen AQUAEXCEL (2015-2020), des chercheurs européens venant de différents pays ont été accueillis pour réaliser des expérimentations : Belgique (Université de Namur), Hongrie (Szent István University), Pologne (Polish Academy of Sciences) et République Tchèque (University of South Bohemia).
Chaque année, dans le cadre de la formation continue, une formation complémentaire en expérimentation animale sur les poissons est organisée. Des formations ont été aussi dispensées à des collègues marocains, indonésiens et nord-coréens dans le cadre de programmes de collaboration financés par divers organismes (Ambassade de France, FAO).
Accueil de chercheurs et de formations
- Optimisation du protocole d’élevage larvaire du sandre (projet européen DIVERSIFY, 2013-2018).
- Effets de la photopériode sur la reproduction de la perche commune (AQUAEXCEL).
- Étude de l’alimentation lipidique sur le succès de reproduction chez la perche commune (FEAMP PERCIHATCH, 2018-2021).
- Effets de la température en phase pré-ovulatoire sur la qualité de la reproduction de la perche mâle et conséquences sur la cryoconservation du sperme (AQUAEXCEL- CRYOPERCH).
- Optimisation du protocole de grossissement de la perche commune en circuit fermé (SARL Lucas Perches).
Coordonnées
Référents opérationnels :
- Dr HDR Sylvain MILLA, animateur du groupe projet DAC
Sylvain.Milla@univ-lorraine.fr ; Tél. 03.72.74.51.99.
- Yannick LEDORE, Assistant-Ingénieur de recherche
Responsable technique et biologique de la PEA
Yannick.ledore@univ-lorraine.fr ; Tél. 03.72.74.50.71.
- Dr HDR Marielle THOMAS, Capacitaire en faune sauvage
Responsable par délégation de l’animalerie poissons
Marielle.thomas@univ-lorraine.fr ;Tél. 03.72.74.52.02.
Sites web de la plateforme :
Les informations sur le laboratoire URAFPA et l’équipe DAC sont disponibles sur le site :
Plateforme Expérimentale en Aquaculture PEA
bâtiment 1er cycle
Faculté des Sciences et Technologies de Nancy
Boulevard des Aiguillettes
BP 70239
54506 VANDOEUVRE-LES-NANCY CEDEX
PEPLor
Plateforme Expérimentale Phytotronique de Lorraine
Présentation
Un phytotron est un outil de recherche en biologie végétale. Il permet de cultiver des plantes dans un espace confiné dans lequel les paramètres agissant sur la croissance des plantes sont régulés. Ces paramètres sont la température, l’hygrométrie, l’éclairement (intensité, spectre, période) mais aussi selon le besoin la composition de l’atmosphère (taux de CO2, d’ozone, etc.).
Afin d’obtenir les conditions climatiques désirées, le phytotron est équipé d’un éclairage adapté (lampes à décharge halogénure et sodium, tubes à fluorescence, lampe à incandescence ou LED), de régulation de la température et d’humidificateurs de générant de la vapeur d’eau. Les paramètres climatiques sont programmés de façon à simuler des évolutions climatiques, suivis en continu et enregistrés.
Les dispositifs expérimentaux phytotronique de l’Université de Lorraine sont regroupés au sein de l’infrastructure fédérative PEPLor, permettant de réaliser des expérimentations sous conditions climatiques contrôlées et variées (atmosphère enrichi en CO2 ou ozone, vernalisation, conditions confinées S2). La plateforme implique 5 unités mixtes de recherche UL/INRAE et UL/CNRS. Les objectifs de recherches des laboratoires associés sont de comprendre et d’exploiter l’adaptation des plantes à leur environnement (nutrition, climat, bioagresseurs…), d’évaluer la biodisponibilité des polluants et de prédire leur transfert vers les plantes.
La plateforme est labélisée dans le cadre du programme qualité de l’Université de Lorraine INFRA+.
Equipements
- Phytotrons haute intensité lumineuse
- Phytotron moyenne intensité lumineuse
- Phytotrons haute intensité lumineuse, atmosphère enrichie en co2
- Phytotron haute intensité lumineuse -4°c
- Phytotron haute intensité lumineuse, OGM
- Phytotron haute intensité lumineuse monoplan
- Phytotron haute intensité lumineuse, atmosphère enrichi en o3 ou en co2
- Armoire de culture aralab
- Armoire de culture binder
- Incubateur culture d’algues
Coordonnées
Plateforme Expérimentale Phytotronique de Lorraine, PEPLor
Site ENSAIA
Responsable : Alexandre OLRY
tel : 03 72 74 40 62
Site web de la plateforme : peplor.univ-lorraine.fr
PEPLor
ENSAIA, 2 avenue de la Forêt de Haye, BP20163
54505 Vandoeuvre-lès-Nancy
PTEGF
Plateforme d'écogénomique
Présentation
La plateforme technique d’écogénomique fonctionnelle (PTEGF) rassemble des équipements dédiés à l’étude des écosystèmes forestiers et des interactions arbres-champignons-bactéries via des outils de génomique, transcriptomique, bio-informatique ainsi que l’imagerie à fluorescence.
Elle fait partie de l’UMR Interactions arbre-microorganismes (IAM) et elle est localisée sur le campus de Champenoux d’INRAE.
Equipements
Composante Génomique
Contrôle qualité des acides nucléiques
- Fragment Analyzer
- TapeStation 2200
- Nanodrop 1000
- Qubit 2.0
Analyse des acides nucléiques
- Droplet Digital PCR system
- SeqStudio Genetic analyzer
- qPCR Rotorgene
- Robot de pipetage Qiagility
- qPCR StepOnePlus
- qPCR Mic
Composante Bioinformatique
- Cluster de calcul
- Baies de stockage
Composante Microscopie
Nos équipements étaient intégrés dans le pôle Imagerie-Microscopies de SILVATECH
Coordonnées
Responsable : Annegret Kohler
Ingénieur de Recherche-INRAE
03.83.39.40.72
Site web de la plateforme : https://mycor.nancy.inra.fr/IAM/?page_id=6365
PTEGF
Institut National de la Recherche Agronomique
Centre INRAE Nancy-Lorraine
Route d’Amance
54280 Champenoux
Silvatech
Plateforme Silvatech
Présentation
SILVATECH est une plateforme dédiée à l’analyse d’échantillons issus des compartiments de l’écosystème forestier (arbre et bois, eau, sol). Elle offre une large gamme de technologies et méthodes dont la combinaison originale permet de décrypter les structures, propriétés et fonctions biologiques de l’arbre vivant au sein de son écosystème jusqu’au bois matériau, des échelles moléculaires à la parcelle forestière. SILVATECH apporte une expertise et une capacité de développement méthodologique aux programmes scientifiques en écologie fonctionnelle, écophysiologie, biogéochimie et sciences du bois.
Equipements
SILVATECH organise ses services d’analyse et de développement en 3 pôles technologiques connectés, qui s’appuient sur des plateaux ou ateliers de préparation équipés et ouverts :
- Pôle Isotopie-Chimie : couplages de spectrométrie de masse standard ou isotopique, de chromatographies, de plasma, dédiés à l’analyse isotopique, minérale, moléculaire à macromoléculaire de matrices complexes (bois, sève, feuilles, sol, eau).
- Pôle Imagerie-Microscopies : imagerie électronique et confocale à haute-résolution, cryomicroscopie-électronique, microanalyses X minérales, histologie et microscopie photonique.
- Pôle d’Imagerie-RX : scanner tomographique, ITRAX, microdensitomètre, diffraction RX.
Coordonnées
Nicolas ANGELI
Ingénieur de Recherche-INRAE
nicolas.angeli@inrae.fr
03.83.39.41.21
Adresse e-mail de contact : silvatech@inrae.fr
Lien plateforme : https://www6.nancy.inrae.fr/silva/Plateformes/SilvaTech
Silvatech
Institut National de la Recherche Agronomique
Centre Grand-est INRAE
Route de l’arboretum
54280 Champenoux