IAM

Mot du directeur

L’Unité mixte de recherche Université de Lorraine INRAE 1136 Interactions Arbres/Microorganismes (IAM) étudie la biologie et l’écologie des interactions qui s’établissent entre les arbres, les champignons et les bactéries rhizosphériques et des sols forestiers, qui contribuent au fonctionnement et à la durabilité des écosystèmes forestiers.

Pascal Frey

Directeur


Directeur

Pascal FREY (INRAE)
pascal.frey@univ-lorraine.fr

Directeur adjoint

Nicolas ROUHIER(Université de Lorraine)
nicolas.rouhier@univ-lorraine.fr

Responsables d’équipes

Ecogénomique des interactions Stéphane Uroz (INRAE)

Ecologie des champignons pathogènes forestiers

Pascal Frey (INRAE)

Réponse aux stress et régulation redox
Mélanie Morel-Rouhier(Université de Lorraine)

Référente Administrative

Corinne TEISSIER (Université de Lorraine)
corinne.teissier@univ-lorraine.fr

Agnès DIDIER (INRAE))
agnes.didier@inrae.fr

Marie Claude MONCHABLON (INRAE)
marie-claude.monchablon@inrae.fr

Nicole THIRION (INRAE)
nicole.thirion@inrae.fr

Présentation

L’Unité Mixte de Recherche Interactions Arbres / Micro-organismes (IAM) Université de Lorraine (UL) / INRAE a été créée le 1er janvier 2001. Elle est issue d’une fusion entre le laboratoire INRA de Microbiologie forestière et le laboratoire de Biologie Forestière de l’Université Henri Poincaré à laquelle s’est rattaché le laboratoire INRA de Pathologie forestière en janvier 2005. Depuis sa création, l’unité présente donc la particularité d’être localisée sur deux sites géographiques distincts : le campus INRA de Champenoux et la Faculté des Sciences et technologies à Vandoeuvre-lès-Nancy. En 2020, suite à la fusion entre les instituts de recherche INRA et IRSTEA, l’UMR est sous la double tutelle de l’Université de Lorraine et INRAE. Depuis 2020, l’unité est dirigée par un directeur (S. Duplessis, DR INRAE) assisté de deux directeurs adjoints (P. Frey, DR INRAE & N. Rouhier, PR UL). Elle est composée de 44 personnels permanents (31 INRAE, 13 UL) et elle accueille une cinquantaine de personnels non-permanents par an.

Depuis sa création, la mission première de l’UMR IAM est d’approfondir les connaissances sur la biologie et l’écologie des interactions entre micro-organismes et arbres forestiers avec l’objectif d’améliorer la compréhension du fonctionnement des écosystèmes forestiers et de pouvoir à terme proposer une gestion durable de ces écosystèmes dans le contexte actuel d’intensification des activités humaines et de changement global. Cette continuité thématique, articulée principalement autour de la compréhension des interactions s’établissant entre les arbres et la cohorte de micro-organismes (bactéries et champignons) qui leurs sont associés au sein des écosystèmes forestiers, se structure autour de deux axes : la biologie intégrative et l’écologie de ces interactions.

Ces axes structurants permettent d’aborder l’étude de ces interactions par des approches multidisciplinaires et complémentaires et ce à différentes échelles spatio-temporelles. Cette structuration nous semble pertinente pour répondre aux trois objectifs scientifiques principaux que nous nous sommes fixés à savoir :

  • La compréhension des mécanismes moléculaires, écologiques et environnementaux régissant les interactions entre les arbres et les micro-organismes
  • La compréhension du rôle fonctionnel des interactions entre arbres et micro-organismes au sein des écosystèmes forestiers
  • La compréhension des processus régissant l’évolution et l’adaptation des associations arbres / micro-organismes pour permettre une meilleure anticipation des impacts potentiels liés aux changements globaux

L’unité IAM est structurée en trois équipes de recherche :

  • Ecogénomique des interactions (Responsable : Stéphane Uroz, DR INRAE) :

Cette équipe développe un projet qui vise à décrypter les mécanismes moléculaires qui régissent le continuum d’interactions entre arbres, champignons, bactéries et sol afin d’améliorer la compréhension de la structure et de la fonction des communautés microbiennes forestières, à travers trois axes de recherche interconnectés, (i) génomique évolutive des modes de vie fongiques, (ii) mécanismes moléculaires des interactions arbres-champignons-bactéries-sols et (iii) diversité et fonction des communautés microbiennes.

  • Ecologie des champignons pathogènes forestiers (Responsable : Pascal Frey, DR INRAE) :

Cette équipe travaille sur l’étude de l’écologie, de l’épidémiologie et de la biologie évolutive des maladies émergentes des arbres forestiers et notamment sur quelques-unes des principales maladies forestières (rouille du peuplier, chalarose du frêne, dépérissement des aulnes, oïdium du chêne).

  • Réponse aux stress et régulation redox (Responsable : Mélanie Morel-Rouhier, PR UL) :

Forte d’une expertise dans l’analyse structure/fonction des protéines, cette équipe développe deux axes de recherche, (i) la réponse aux contraintes environnementales des arbres et plus globalement des plantes et (ii) la dégradation de la matière organique par les champignons saprophytes au sein des écosystèmes forestiers.

Tutelle(s)

Thématiques de recherche / Savoirs faire

Les orientations scientifiques des équipes :

L’unité est organisée en trois équipes de recherche et une équipe de sciences et recherches participatives :

L’équipe Réponse aux stress et régulation redox (RSRR) a organisé son activité autour de deux grands axes de recherche, i) la réponse aux contraintes environnementales des arbres et plus globalement des plantes et ii) la dégradation de la matière organique par les champignons saprophytes au sein des écosystèmes forestiers en se reposant sur une expertise forte dans l’analyse structure/fonction des protéines.

L’équipe Ecogénomique des interactions (EGI) structure ses recherches autour de trois axes scientifiques principaux qui sont i) la génomique évolutive des modes de vie fongique, en se reposant sur une expertise forte en génomique dans le cadre de collaborations internationales ; ii) les mécanismes moléculaires mis en jeu au sein d’un continuum d’interactions arbre-champignons-bactéries-sol ; et iii) la diversité et les fonctions des communautés microbiennes forestières. 

L’équipe Ecologie des champignons pathogènes forestiers (ECPF) a organisé son projet autour de quatre tâches scientifiques principales qui sont i) l’émergence des maladies des arbres forestiers et leurs causes ; ii) la dispersion des agents pathogènes et leurs conséquences ; iii) l’adaptation des agents pathogènes à leurs hôtes et iv) l’effet des maladies sur les populations et communautés d’arbres.

Tous Chercheurs (TC) développe une pédagogie et une ingénierie basée sur le principe « apprendre en faisant » à destination d’un très large public (scolaires, professionnels, entreprises, grand public). Le périmètre d’activité de cette plateforme de sciences et recherches participatives va au-delà de l’unité IAM ou des objets étudiés au sein de l’unité.

L’UMR IAM héberge les Start-Ups WeTruf (INRAE Grand Est – Nancy) et Profilia (Faculté des Sciences et Technologies, Vandoeuvre) créées entre 2020 et 2022 par des chercheurs de l’unité.

Réseaux / Financement / Partenaires

+60

Enseignants-Chercheurs

+79

Chercheurs

+152

BIATSS et ITA

+300

Publications