Plateforme ASIA : Approches fonctionnelles et Structurales des InterActions cellulaires
Actualités
22 octobre 2024
QVCT
Des vestes polaires pour l'équipe ASIA, grâce au pôle A2F
Affronter l’hiver à Nancy, c’est un peu comme se préparer pour une expédition polaire… Mais cette année, l’équipe de la plateforme ASIA est prête ! Grâce au financement du pôle scientifique A2F, les cinq membres de l’équipe ont été équipés de vestes polaires, un geste qui s’inscrit dans la démarche d’amélioration de la qualité de vie et des conditions de travail (QVCT) initiée par le pôle.
Ces vestes, brodées du logo de la plateforme ASIA, ne sont pas seulement un rempart contre le froid dans les espaces de travail peu chauffés. Elles sont aussi un véritable atout en termes de communication visuelle, permettant aux membres de l’équipe de porter fièrement les couleurs de la plateforme. En alliant fonctionnalité et identité visuelle, elles renforcent la cohésion de l’équipe.
Cette acquisition témoigne de l’engagement du pôle A2F dans l’amélioration du bien-être des employés. En plus d’assurer leur confort au quotidien, l’initiative valorise l’image professionnelle de la plateforme. L’équipe ASIA a chaleureusement salué cette démarche.
12 septembre 2024
Aquisition
Installation de l'heliX+ appareil de dernière génération
En juin 2024, la plateforme ASIA franchit une nouvelle étape dans l’innovation scientifique en intégrant le tout nouvel appareil heliX+, une technologie de pointe dédiée à l’étude des interactions biologiques en temps réel. Cet équipement de dernière génération, qui utilise la technologie switchSENSE déjà présente sur la plateforme depuis 2017, place ASIA à l’avant-garde de la recherche française. La plateforme devient la première structure scientifique en France à maîtriser cet instrument.
La technologie switchSENSE, développée par la société allemande Dynamic Biosensors (DBS ; Munich), est une technologie de biocapteurs innovante qui utilise des sondes nanométriques d’ADN fixées à la surface d’une puce. Une fois fonctionnalisées avec un fluorophore, ces sondes permettent de mesurer avec précision les interactions entre biomolécules, telles que les protéines, les acides nucléiques ou les petites molécules. Cette technologie unique offre des informations cruciales sur les mécanismes de reconnaissance moléculaire. L’installation du DRX en 2017, appareil de première génération, a marqué un tournant dans l’analyse des interactions biomoléculaires au sein de la communauté universitaire lorraine grâce à sa capacité à suivre des cinétiques de liaison et de dissociation reposant sur la technologie innovante switchSENSE. Il a permis d’obtenir des données riches et complètes sur les mécanismes moléculaires régulant le fonctionnement de la cellule, devenant ainsi un outil incontournable.
L’heliX+, appareil de seconde génération, va encore plus loin en intégrant des avancées technologiques significatives qui améliorent la sensibilité, la résolution temporelle et la polyvalence des mesures. L’heliX+ fonctionne notamment grâce à des sondes d’ADN robustes construites avec la technique d’origami ADN, permettant d’étudier des interactions encore plus complexes dans les conditions plus proches des conditions physiologiques.
L’installation de l’heliX+ sur la plateforme ASIA s’inscrit dans la continuité des efforts pour offrir aux chercheurs des outils à la pointe de la technologie. Depuis l’acquisition de la technologie switchSENSE en 2017, ASIA a développé un savoir-faire reconnu dans l’analyse des interactions biologiques, contribuant à plusieurs projets de recherche d’envergure nationale et internationale. Avec l’arrivée de l’heliX+, la plateforme renforce sa position de leader dans le domaine et confirme son engagement à soutenir l’innovation scientifique.
La plateforme ASIA se réjouit de mettre à disposition de la communauté scientifique universitaire ce nouvel outil, qui profitera également à tous les partenaires académiques et industriels de la plateforme et qui consolide ainsi sa mission de soutien à la recherche et au développement technologique.
Pour plus d’informations ou pour discuter d’une collaboration, n’hésitez pas à contacter l’équipe d’ASIA.
11 juillet 2024
Communication
Présentation de la plateforme au village A2F
Le 10 juin dernier, la plateforme ASIA a participé au village A2F sous la yourte et dans le jardin de Kèpos de Vandœuvre-lès-Nancy en présence d’Hélène Boulanger, présidente de l’Université de Lorraine. Cette rencontre organisée par le pôle Agronomie, Agroalimentaire, Forêt de l’Université de Lorraine vise à améliorer la transversalité des échanges au sein du pôle et a réuni près de 120 de personnes qui ont présenté et découvert les posters affichés pour l’occasion.
21 mai 2024
Médiation
Des lycéens en visite à la plateforme ASIA
Les olympiades de biologie, concours national, visent à stimuler l’intérêt des lycéens pour les sciences de la vie et de la Terre. Chaque année, des équipes de jeunes passionnés, issus de divers établissements scolaires, s’affrontent sur des épreuves pratiques en équipe, démontrant leurs connaissances approfondies et leur esprit d’innovation. Ces olympiades sont non seulement un défi académique, mais aussi une occasion de se distinguer et de se préparer à des carrières scientifiques. Le thème de cette année : La Biodiversité dans les écosystèmes : Du micro au macro, des abysses aux sommets.
Le mercredi 15 mai 2024, les lauréats de cette édition ont eu l’honneur de visiter la plateforme technologique ASIA ainsi que d’autres laboratoires de recherche de la Faculté des Sciences et Technologies de Nancy. Cette visite a permis à des lycéens de plonger au cœur de la recherche scientifique. Guidés par des chercheurs et accompagnés par des enseignants, ils ont exploré des laboratoires de pointe et participé à des ateliers interactifs, découvrant les dernières avancées en biotechnologies. Cette visite inspirante a non seulement récompensé leurs efforts académiques, mais a peut-être également suscité des vocations scientifiques, incitant ces jeunes à envisager des carrières dans les sciences et la recherche. Une journée mémorable pour ces futurs scientifiques !
Plus d’information sur les olympiades de biologie ici : https://www.education.gouv.fr/olympiades-nationales-de-biologie-303345
16 février 2024
Vidéo
Tournage d'une vidéo de présentation de la plateforme ASIA
Le 19 et 20 octobre dernier, a eu lieu le tournage d’une vidéo de présentation de la plateforme ASIA. Le responsable opérationnel et la responsable fonctionnelle vous invitent chaleureusement à visionner cette vidéo dans la rubrique présentation du site de la plateforme ASIA ou sur ULTV :
06 octobre 2023
ORION
On parle de nous !
Dans le cadre de la semaine de la recherche et du programme ORION, les différentes structures d’appuis à la recherche du pôle A2F, dont la plateforme ASIA, ont organisé une présentation et une table ronde autour des métiers de la recherche. Quelques étudiants intéressés ont ainsi assisté à une présentation des plateformes et des différents métiers associés (ITRF essentiellement). Ils ont également pu échanger avec les intervenants et visiter ASIA.
22 mai 2023
Publication
Dégradation du bois de vigne par Fomitiporia mediterranea
PUBLICATION : Dégradation du bois de vigne par Fomitiporia mediterranea.
L’amadou ou pourriture blanche parfois observée au sein du bois de vigne est un symptôme caractéristique de l’Esca, une des principales maladies du bois de la vigne. Le champignon Fomitiporia mediterranea est l’espèce fongique majoritaire en Europe dans cette pourriture.
Des chercheurs de l’UMR 1136 IAM de Nancy en collaboration avec l’UMR-A 1131 SVQV et l’UPR-3991 LVBE de Colmar ont tenté de comprendre les mécanismes permettant à Fomitiporia mediterranea de dégrader le bois et notamment le bois de vigne. Ils ont mis en évidence un schéma de dégradation simultané du bois de vigne par le champignon ainsi que du bois de hêtre utilisé comme référence. Concernant la dégradation spécifique du bois de vigne, l’étude a montré, une surproduction relative d’oxydoréductases par Fomitiporia mediterranea. Ces enzymes sont notamment impliquées dans la dégradation de la lignine. Seulement quelques différences dans les enzymes actives sur les hydrates de carbone ont pu être mises en évidence.
Ces résultats pourraient partiellement expliquer l’adaptation de Fomitiporia mediterranea à la composition structurelle du bois de vigne par rapport à d’autres espèces de bois, et suggèrent que d’autres facteurs biotiques et abiotiques devraient être pris en compte pour comprendre pleinement l’adaptation potentielle de ce champignon à sa niche écologique.
La technologie Fibrebag disponible sur la plateforme ASIA a permis de déterminer le contenu en polymères de la structure du bois ainsi que la proportion en extractibles des différents échantillons.
Les résultats ont fait l’objet d’une publication dans Frontiers in Plant Science [Schilling, M., Maia-Grondard, A., Baltenweck, R., Robert, E., Hugueney, P., Bertsch, C., Farine, S., & Gelhaye, E. (2022). Wood degradation by Fomitiporia mediterranea M. Fischer : Physiologic, metabolomic and proteomic approaches. Frontiers in Plant Science, 13, 988709. https://doi.org/10.3389/fpls.2022.988709].
12 mai 2023
Publication
Des polygalacturonases végétales pour ajuster les pectines de la paroi cellulaire
PUBLICATION : DES POLYGALACTURONASES VEGETALES POUR AJUSTER LES PECTINES DE LA PAROI CELLULAIRE
Les parois cellulaires des plantes sont composées d’un réseau de pectines dont le réglage fin par les polygalacturonases joue un rôle clé dans la modulation de la chimie et de la mécanique de la paroi cellulaire, ce qui a un impact sur le développement des plantes.
Des chercheurs de l’UMRT INRAE 1158 BioEcoAgro – BIOPI Biologie des Plantes et Innovation, Université de Picardie (Amiens), en collaboration avec de nombreuses équipes de chercheurs, présentent les deux premières structures cristallines de polygalacturonases d’Arabidopsis thaliana, la PGLR et l’ADPG2 qui sont co-exprimées pendant le développement de la racine.
L’UMR 1136 IAM (Université de Lorraine) a collaboré à ce travail et a notamment utilisé la technologie switchSENSE disponible sur la plateforme ASIA afin de déterminer les dynamiques enzymes-substrats.
Les résultats viennent de faire l’objet d’une publication dans The Plant Cell [Safran J., Tabi W., Ung V., Lemaire A., Habrylo O., Bouckaert J., Rouffle M., Voxeur A., Pongrac P., Bassard S., Molinié R., Fontaine J.-X., Pilard S., Pau-Roblot C., Bonnin E., Larsen D.S., Morel-Rouhier M., Girardet J.M., Lefebvre V., Sénéchal F., Mercadante D., & Pelloux J. (2023). Differences in the crystal structure of plant polygalacturonases specify enzymes’ dynamics and processivities to fine-tune cell wall pectins. https://doi.org/10.1101/2022.06.22.497136].
05 septembre 2022
Partenariat
ASIA partenaire du programme ORION
Depuis le 25 novembre 2021, le programme ORION a lancé un appel à candidatures pour financer des TP d’excellence dans le but de faciliter l’accès à des plateformes expérimentales de pointe aux étudiants de Master des campus lorrains et aux élèves-ingénieurs. Entretien avec Céline Cakir-Kiefer : http://factuel.univ-lorraine.fr/node/20025
11 mai 2022
Publication
Propriétés antioxydantes de la lactoferrine de jument du Kazakhstan
PUBLICATION : Propriétés antioxydantes de la lactoferrine de jument du Kazakhstan
La lactoferrine est une protéine soluble présente dans le lait et est connue pour ses propriétés antimicrobiennes (antibactériennes, antifongiques, antivirales, etc.) ainsi que pour son rôle dans la défense immunitaire. En collaboration avec des chercheurs de l’UR AFPA et des chercheurs de la Faculté de Biologie et Biotechnologie d’Almaty (Kazakhstan), nous avons exploré les propriétés antioxydantes de la lactoferrine purifiée à partir de lait de juments du Kazakhstan en déterminant sa capacité à chélater des ions métalliques oxydants tels que le zinc, le fer et le cuivre au moyen de la technologie switchSENSE® disponible sur la plateforme ASIA.
Les résultats viennent de faire l’objet d’une publication dans LWT Food Science and Technology : Narmuratova Z., Hentati F., Girardet J.M., Narmuratova M., & Cakir-Kiefer C. (2022). Equine lactoferrin: Antioxidant properties related to divalent metal chelation. LWT Food Science and Technology, 161, 113426 [doi.org/10.1016/j.lwt.2022.113426].
19 janvier 2022
Séminaire
Annonce de séminaire switchSENSE : nouveauté HELIX
Vous trouverez ci dessous l’annonce d’un séminaire le 8 mars prochain par Amandine GONTIER de la société Dynamic Biosensors (Munich) qui nous présentera le nouvel équipement HELIX basé sur la technologie originale switchSENSE pour l’étude des interactions biomoléculaires en temps réel et la conformation des protéines.
22 octobre 2021
Cérémonie
ASIA à la remise de diplômes du programme INFRA+ de LUE
ASIA à la remise de diplômes du programme INFRA+ de LUE
Dans le cadre de la cérémonie organisée le 15 octobre dernier à l’Abbaye des Prémontrés de Pont-à-Mousson à l’occasion de la pérennisation de l’I-site Lorraine Université d’Excellence (LUE), a eu lieu la remise des diplômes de labellisation StAR-LUE du programme INFRA+.
Les 24 structures labellisées au cours des années 2020-2021 ont été mises à l’honneur les unes après les autres en présence de Pierre Mutzenhardt, Président de l’Université de Lorraine, Karl Tombre, Directeur exécutif de Lorraine Université d’Excellence ainsi que Erwin Dreyer, Responsable du programme INFRA+.
A cette occasion la plateforme ASIA ainsi que deux autres structures labellisées ont été sollicitées pour présenter à l’assistance un retour d’expérience de la mise en place de la Démarche Qualité.
Jean-Michel Girardet et Emilie Robert, responsables opérationnel et fonctionnelle de la plateforme ASIA ont donc présenté la plateforme et fait état de la mise en place de la Démarche Qualité depuis l’appel à manifestation d’intérêt (AMI 2018) jusqu’aux premières retombées.
Cet évènement a été l’occasion de rencontrer et d’échanger avec des collègues également impliqués dans la mise en place d’une Démarche Qualité.
13 octobre 2021
Communication
ASIA a participé au usermeeting switchSENSE
Biophysical Method and switchSENSE User Meeting – Munich Sep 15-17, 2021
Jean-Michel Girardet a participé au dernier User Meeting organisé par la société Dynamic Biosensors qui développe la technologie switchSENSE. Il a présenté en une trentaine de minutes les derniers résultats obtenus avec le switchSENSE de la plateforme ASIA concernant (i) l’étude de l’interaction entre des glutathion transférases (GST) de la famille Ure2p et le facteur d’élongation de la transcription EF1Bg (projet de Mélanie Morel-Rouhier, UMR1136 IAM) et (ii) l’étude de la prise en charge par les lipoprotéines plasmatiques humaines HDL et LDL du chlordécone, un pesticide organochoré (projet de Céline Cakir, UR AFPA). Ce séminaire fut également un moment convivial d’échanges entre les utilisateurs ou futurs utilisateurs concernant leur expérience de cette technologie somme toute assez récente.
22 juillet 2021
Publication
Ouvrage sur les protéines sources de peptides bioactifs
Bio-fonctionnalité des peptides alimentaires liant les minéraux : Etat de l’art et nouveaux développements
En collaboration avec des collègues des unités de recherches LRGP, CITHEFOR, l’université d’Antioquia (Medellin, Colombie), LIBio, LCPM, L2CM et STLO (INRAE Rennes), ASIA a participé à la rédaction d’un chapitre d’ouvrage intitulé ” Application in Nutrition: Mineral-Binding” et rédigé par S. El Hajj, T. Sepúlveda-Rincon, K. Selmeczi, C. Paris, T. Giraud, G. Csire, L. Stefan, J-M. Girardet, S. Desobry, S. Bouhallab, L. Muhr, C. Gaucher, et L. Canabady-Rochelle. ASIA a apporté son expertise dans l’étude originale des interactions peptides/minéraux en temps réel en utilisant la technologie switchSENSE.
Cette publication s’inscrit dans le cadre de la thèse de Sarah El Hajj dirigée par Laetitia Canabady-Rochelle (LRGP) et Caroline Gaucher (CITHEFOR), et en lien avec le consortium “peptides chélateurs de métaux” de l’IMPACT Biomolécules (projet LUE 2017-2021).
Référence de la publication :
16 juillet 2021
Médiation
Installation de trois postes de télévision
Grâce à un financement du programme CSTI+ ProBio, la plateforme ASIA diffuse désormais des informations sur l’ensemble du campus Aiguillettes. En effet, trois télévisions ont été acquises dont deux sont installées aux 3e et 6e étages de l’entrée 1B de la Faculté des Sciences et Technologies. Ces deux postes diffusent un flux d’informations concernant les différentes structures identique à huit autres postes sur le campus dont voici la liste :
– Bâtiment administration, hall entrée
– Bâtiment second cycle, atrium niveau haut
– Bâtiment second cycle, atrium niveau bas
– Bâtiment Poincaré, hall entrée principale
– BU, Accueil
– Bâtiment ATELA, hall entrée principale
– Bâtiment AIPL, hall entrée principale
– SUMMPS, site Vélodrome, hall entrée
– Laboratoire IAM, Bâtiment 1B, 3ème hall entrée
– Laboratoire IAM/Plateforme ASIA, Bâtiment 1B, 6ème hall entrée
Ces télévisions ont été mises en service le 13 juillet 2021 et serviront à faire connaître plus largement la plateforme ASIA. Le dernier poste installé dans la salle qui accueille notamment le switchSENSE servira à diffuser des vidéos explicatives concernant les appareils de la plateforme lors de visites organisées dans le cadre de la formation des étudiants et doctorants, lors de l’accueil de nouveaux utilisateurs ou de l’accueil de lycéens et grand public dans le cadre de l’action de médiation scientifique.
16 juin 2021
Communication
ASIA a particité à la 1ère journée du réseau ProteinLorraine
Le lundi 31 mai 2021 la plateforme ASIA a participé à la première journée du réseau scientifique ProteinLorraine. Ce nouveau réseau créé en 2019 regroupe des entités de recherche réparties dans 6 pôles scientifiques de l’Université de Lorraine. Le thème de la journée était « Approches biochimiques, biophysiques et structurales pour les protéines en Lorraine ». 15 présentations ont été proposées à l’auditoire en distanciel pour cause de pandémie de Covid 19. 10 laboratoires et 4 plateformes technologiques étaient représentés.
L’objectif de connaitre ou redécouvrir les différentes activités et thématiques autour des protéines en Lorraine est atteint pour cette première journée.
Jean-Michel Girardet et Emilie Robert sont intervenus en fin de matinée pour faire découvrir la plateforme ASIA et quelques exemples d’applications des appareils à ce public spécialiste des protéines, plus de 90 personnes ont assisté cette présentation. L’intérêt a été vif et le personnel de la plateforme espère que cette initiative permettra de la faire connaitre plus largement.
08 avril 2021
Publication
Étude de OrfG, un composant du T4SS d’ICESt3
ANALYSE STRUCTURALE ET BIOCHIMIQUE DE LA PROTEINE ORFG, UN COMPOSANT DU SYSTEME DE SECRETION DE TYPE IV (T4SS) DE L’ELEMENT INTEGRATIF ET CONJUGATIF ICESt3 DE STREPTOCOCCUS THERMOPHILUS.
Le transfert horizontal des gènes joue un rôle essentiel dans l’acquisition de gènes et contribue notamment à la dissémination de gènes de résistance aux antibiotiques, qui constitue aujourd’hui une menace de santé publique d’une ampleur exceptionnelle au niveau mondial. Un mécanisme majeur du transfert horizontal est la conjugaison bactérienne qui assure la transmission d’éléments génétiques mobiles (EGM), notamment les ICE, d’une bactérie à une autre par contact physique. Le transfert des EGM se fait au travers d’un complexe multi-protéique assemblé dans l’enveloppe bactérienne appelé le système de sécrétion de type IV conjugatif (Conj-T4SS). Dans cette étude, fruit d’une collaboration entre les laboratoires DynAMic et CRM2, nous avons mis en place des approches biochimique et structurale pour caractériser la protéine OrfG. Cette protéine est un composant central du Conj-T4SS d’ICESt3 de la bactérie Gram positive Streptococcus thermophilus. Peu d’informations sont disponibles à ce jour sur les Conj-T4SS des bactéries Gram positives. L’étude cristallographique d’OrfG a permis de montrer que cette protéine présente une structure similaire aux protéines appartenant à la famille VirB8 malgré des identités de séquence très faibles. Comment des protéines avec si peu d’identités de séquence peuvent-elles présenter des structures 3D proches ? Cette question n’est toujours pas résolue à ce jour. Grâce à une analyse structurale approfondie couplée à une étude phylogénétique, nous avons identifié plusieurs classes structurales de ces protéines réparties séparément entre les bactéries Gram négatives et positives. Cela laisse présager des différences significatives sur les modes de fonctionnement des Conj-T4SS entre ces bactéries. Par des analyses biochimiques, nous avons montré que la protéine OrfG forme des hexamères en solution, propriété inédite pour cette famille de protéine. Ces travaux ont, en particulier, utilisé la technologie SEC-MALS-RI de la plateforme ASIA.
Les résultats viennent de faire l’objet d’une publication dans Frontiers in Molecular Biosciences : [Cappele J., Mohamad-Ali A., Leblond-Bourget N., Mathiot S., Dhalleine T., Payot S., Savko M., Didierjean C., Favier F. & Douzi B. (2021). Structural and biochemical analysis of OrfG: the VirB8-like component of the conjugative type IV secretion system of ICESt3 from Streptococcus thermophilus, doi:10.3389/fmolb.2021.642606. eCollection 2021].
15 mars 2021
Labellisation StAR-LUE
La plateforme ASIA obtient le label StAR-LUE
Le travail des personnels de la plateforme ASIA, accompagnés dans leur démarche par Monsieur Laurent Perilhon de la DAPEQ, pour la labellisation de la plateforme ASIA, a porté ses fruits. En effet, suite à son évaluation du mois de février dernier, la plateforme a obtenu une excellente appréciation entraînant l’attribution du label StAR-LUE *** par le Comité exécutif Lorraine Université d’Excellence comme en atteste le document joint en date du 5 mars dernier :
08 février 2021
Evaluation qualité
Evaluation de la plateforme ASIA pour le label StAR-LUE
Le jeudi 04 février 2021 la Plateforme ASIA a été évaluée par mesdames Virginie Marchand et Julie Gonnet de l’UMS IBSLor en vue de l’obtention du label StAR-LUE INFRA+.
La journée d’évaluation s’est déroulée en présence des responsables opérationnel et fonctionnel de la plateforme.
Cette évaluation finalise un long travail de mise en place de la démarche qualité sur cette plateforme encore toute jeune.
08 février 2021
Publication
Diversité phylogénétique des GST de champignons
DIVERSITE PHYLOGENETIQUE DES GLUTATHION TRANFERASES OMEGA DE CHAMPIGNONS
La classe oméga des glutathion transférases (GST) forme une classe distincte au sein de la superfamille des GST cytosoliques, car la plupart d’entre elles possèdent un résidu de cystéine catalytique. La classification des GSTO basée sur 240 génomes de champignons (Agaricomycètes) a été ré-évaluée. Cette analyse conduit à une nouvelle classification dans laquelle les GSTO fongiques sont divisés en deux types A et B. Le résidu catalytique du type A est soit la cystéine soit la sérine, tandis que celui du type B est la cystéine. Les données transcriptomiques montrent que les GSTO de type A sont des enzymes constitutives tandis que celles de type B sont inductibles. L’analyse cristallographique révèle des différences structurelles substantielles entre les deux types, alors qu’ils présentent des profils biochimiques similaires. En outre, ces enzymes ont la capacité de lier des molécules antioxydantes tels que les polyphénols du bois. La multiplication des GSTO pourrait permettent aux organismes fongiques de s’adapter plus facilement à de nouveaux environnements. Ces travaux ont notamment utilisé la technologie switchSENSE de la plateforme ASIA.
Les résultats viennent de faire l’objet d’une publication : [Perrot T., Schwartz M., Deroy A., Girardet J.M., Kohler A., Morel-Rouhier M., Favier F., Gelhaye E. & Didierjean C. (2021). Diversity of Omega Glutathione Transferases in mushroom-forming fungi revealed by phylogenetic, transcriptomic, biochemical and structural approaches. Fungal Genetics and Biology, 148, 103506].
05 janvier 2021
Publication
Un facteur d'élongation impliqué dans la régulation redox
IMPLICATION D’UN FACTEUR D’ELONGATION DE LA TRADUCTION DANS LA REGULATION REDOX
Chez le champignon Phanerochaete chrysosporium, la sous-unité eEF1Bγ du facteur d’élongation EF1 est connue pour agir comme une protéine d’échafaudage stabilisant le complexe EF1. Grâce notamment à des approches thermodynamiques (ITC) et cinétiques (switchSENSE) réalisées sur la plateforme ASIA, des chercheurs de l’UMR IAM ont montré que la sous-unité possède des caractéristiques supplémentaires : Elle est active comme glutathion transférase en présence de glutathion réduit (A), elle change de conformation lors de la liaison du glutathion oxydé (B), et le glutathion oxydé favorise l’interaction entre eEF1Bγ et la glutathion transférase Ure2p (C), suggérant une régulation redox présumée du facteur d’élongation.
Les résultats viennent de faire l’objet d’une publication dans The FEBS Journal [Bchini R., Girardet J.M., Sormani R., Gelhaye E. & Morel-Rouhier M. (2020). Oxidized glutathione promotes association between Eukaryotic Translation Elongation Factor 1Bγ and Ure2p glutathione transferase from Phanerochaete chrysosporium. https://doi.org/10.1111/febs.15614].
16 octobre 2020
Publication
Mise en évidence du rôle physiologique d'une protéine BolA
MISE EN EVIDENCE DU ROLE PHYSIOLOGIQUE D’UNE PROTEINE BACTERIENNE DE TYPE BolA
Sinorhizobium meliloti est une bactérie fixatrice d’azote formant des nodules symbiotiques avec la légumineuse Medicago truncatula. Cette bactérie possède une protéine de type BolA, appelée YrbA, dont le rôle physiologique est inconnu. Dans les organismes où les protéines BolA et les glutaredoxines monothiol (Grxs) sont présentes, elles contribuent à la régulation de l’homéostasie du fer et aussi à la maturation des protéines possédant un centre fer-soufre.
Grâce notamment à des approches thermodynamiques (ITC) et cinétiques (switchSENSE) réalisées sur la plateforme ASIA, des chercheurs de l’UMR IAM, de l’UMR CRM2 et de l’ISA de Sophia Antipolis ont pu montrer que YrbA coordonne divers ions métalliques divalents (fer, cobalt, nickel, cuivre et zinc) et possède la capacité de former des hétérodimères avec la seule glutaredoxine monothiol (Grx2) présente dans cette espèce. Cette étude aide à clarifier le rôle physiologique des protéines de type BolA dans les bactéries.
Les résultats viennent de faire l’objet d’une publication dans Bioscience Reports [Roret T., Alloing G., Girardet J.M., Perrot T., Dhalleine T., Couturier J., Frendo P., Didierjean C. & Rouhier N. (2020). Sinorhizobium meliloti YrbA binds divalent metal cations using two conserved histidines. Biosci. Reports, 40, BSR20202956].
15 octobre 2020
Communication
Présentation de résultats obtenus sur ASIA à New York
29 septembre 2020
Annuaire
ASIA référencée dans l'annuaire Plug in Labs Lorraine
Dans le cadre de l’I-SITE Lorraine Université d’Excellence et plus précisément du programme Infra+, le portail lorrain des compétences de la recherche “Plug in labs Lorraine” est désormais en ligne !
Ce portail est un annuaire numérique qui présentera l’offre des infrastructures et des unités de recherche du site lorrain (Université de Lorraine, CNRS, INRAE, Inria, Inserm, CHRU de Nancy) en matière de recherche, compétences scientifiques et techniques, équipements, technologies et ingénierie. Il orientera les acteurs académiques et du monde socio-économique vers les différentes compétences pour favoriser l’émergence de projets collaboratifs et de prestations high-tech. Il présentera sous la forme de fiche les compétences, les équipements, les technologies et certains brevets, issus des infrastructures de recherche et des unités de recherche. La recherche pourra se faire par mots-clés libres, en fonction des thématiques phares du site lorrain ou par type de services recherchés (brevet, prestation …). En somme, Plug in labs Lorraine cartographiera les compétences et promouvra les expertises scientifiques afin de favoriser les échanges avec les acteurs socio-économiques.
Pour le moment, seules les infrastructures de recherche (plateformes) sont présentées sur Plug in labs Lorraine.
La présentation des Unités de recherche est en cours de finalisation et sera accessible sur le portail d’ici la fin de l’année.
Retrouvez ASIA dans l’annuaire Lorrain disponible depuis peu :
https://pluginlabs.univ-lorraine.fr/fr/results/keywords/ASIA
25 septembre 2020
Publication
Étude de la fixation du chlordécone sur des lipoprotéines
ETUDE IN VITRO EN TEMPS REEL DE LA FIXATION D’UN PESTICIDE (CHLORDECONE) SUR DES LIPOPROTEINES PLASMATIQUES HUMAINES
Le chlordécone est un polluant organique persistant (POP) chloré que l’on retrouve encore actuellement dans les sols malgré son interdiction en 1993, notamment dans les bananeraies aux Antilles. Une fois absorbé, il s’accumule dans le foie tandis que son métabolite, le chlordécol, est plutôt retrouvé dans la bile. La contamination peut avoir un impact sérieux sur la santé, notamment une incidence accrue du cancer de la prostate et des troubles du développement neurologique.
Grâce à la technologie innovante switchSENSE® disponible sur ASIA, des chercheurs de l’URAFPA ont pu montrer pour la première fois que le chlordécone se lie spécifiquement aux lipoprotéines plasmatiques LDL avec une forte affinité (KD de 1 µM), mais ne se fixe pas aux HDL. L’inverse est observé pour le chlordécol. Ces travaux permettent ainsi de mieux comprendre comment le chlordécone et le chlordécol sont différemment véhiculés dans la circulation sanguine pour atteindre des cibles tissulaires spécifiques.
Les résultats viennent de faire l’objet d’une publication dans Environmental Toxicology and Pharmacology [Delannoy M., Girardet J.M., Djelti F., Yen F.T. & Cakir-Kiefer C. (2020). Affinity of chlordecone and chlordecol for human serum lipoproteins. Environ. Toxicol. Pharmacol. 80, 103486. doi.org/10.1016/j.etap.2020.103486].
https://www.agefotostock.com/age/en/Stock-Images/Royalty-Free/SPH-F012-8901
20 juillet 2020
Publication
Étude de la régulation génique des kinamycines
ETUDE IN VITRO EN TEMPS REEL DE LA REGULATION GENIQUE DE LA PRODUCTION DE KINAMYCINES, UNE FAMILLE D’ANTIBIOTIQUES PRODUITE PAR LA BACTERIE STREPTOMYCES AMBOFACIENS.
Une équipe de l’UMR UL-INRAE 1128 DynAMic s’intéresse à la régulation de la biosynthèse de kinamycines chez la bactérie Streptomyces ambofaciens. Parmi les différents facteurs de transcription impliqués dans cette régulation, la protéine AlpZ est un acteur majeur qui contrôle négativement la cascade de régulation de la production de kinamycines. Son action est modulée par une molécule de signalisation de nature encore inconnue. La fixation de AlpZ sur la séquence promotrice de ses gènes cibles et son relargage en présence de la molécule signal ont été caractérisés en temps réel en utilisant pour la première fois la technologie switchSENSE® disponible sur la plateforme ASIA. Les résultats viennent de faire l’objet d’une publication dans la revue Frontiers in Microbiology [Vicente C.M., Girardet J.M., Hôtel L. & Aigle B. (2020). Molecular dynamics to elucidate the DNA-binding activity of AlpZ, a member of the gamma-butyrolactone receptor family in S. ambofaciens. Front. Microbiol, 11.:1255. doi: 10.3389/fmicb.2020.01255].
05 juin 2020
Travaux
Avancement des travaux des futurs locaux de la plateforme
02 juin 2020
Evènement
Crise du coronavirus et déconfinement de la plateforme ASIA
Depuis le 18 mai 2020 les équipements de la plateforme ASIA ont repris du service.
Dans le respect strict des mesures barrières en vigueur au sein de l’Université de Lorraine la plateforme ASIA se met au service de la relance de la recherche scientifique à la Faculté des Sciences et Technologies de Nancy.
Le télétravail reste néanmoins la norme pour toutes les activités faisables à distance.
Les responsables opérationnel et fonctionnel sont à votre écoute afin de satisfaire au mieux les demandes de mises à disposition et de prestations en toute sécurité.
Prenez soin de vous et de vos familles !
23 avril 2020
Evènement
Crise du coronavirus et confinement de la plateforme ASIA
Depuis le 16 Mars 2020 le télétravail est de mise pour le personnel de la plateforme ASIA.
L’occasion de créer un site fonctionnel et attractif pour la nouvelle structure d’appui à la recherche :
ASIA et son personnel ont tenu à soutenir les soignants pendant cette épreuve et ont fait don de leur stock de gants à usage unique et de gel hydroalcoolique au Médipôle de Gentilly et à la polyclinique Louis Pasteur Santé.
La plateforme ASIA est évidemment fermée pour le moment.
Prenez soin de vous et de vos familles !
Le coronavirus Sars-CoV-2 vu au microscope, le 27 février 2020. (NATIONAL INSTITUTES OF HEALTH / AFP)