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Post-Doctoral Position

Post-Doctoral Position

24 months
Laboratoire d’Ingénierie des Biomolécules – LIBio
Nancy – France

Generic Encapsulation concept for Lactic acid bacteria


Context
New generation of powders are currently developed for nutritional purposes. Dynamics of this market are supported by consumer interest and demand for healthy foods. Milk powders enriched in probiotics are an important component of this market. The use of dairy proteins under powder form has several advantages, as probiotics delivery in solid form creates a buffered environment protecting against the high acidity encountered in the stomach and forms a dense matrix that physically protects the cells. The issue facing food technologists is that probiotic protection by encapsulation is extremely strain-dependent. Recently, the principal investigator elucidated the interactions between Lactobacillus rhamnosus GG and milk components. Characterization of these interactions is identified as a necessary requirement for an efficient encapsulation process allowing cell targeted delivery.
The postdoctoral fellow will study adhesive interactions between lactic acid bacteria and dairy proteins by using Lactobacillus rhamnosus GG as a model organism.

Expected skills :
The candidate should have excellent skills in cultural microbiology, purification and analyzes of proteins, and in analyzing protein interactions by using Isothermal Titration Calorimetry (ITC). Expertise in ELISA and in handling High-Throughput Screening facilities will also be appreciated.

Duration : 2 years
Starting time : January 2019
Gross annual Salary : 45 000 €
Type of funding : ANR JCJC « GEL »
Laboratory : Laboratoire d’Ingénierie des Biomolécules (LIBio) – Université de Lorraine
Project leader : Pr Claire Gaiani
Contacts : claire.gaiani@univ-lorraine.fr and frederic.borges@univ-lorraine.fr

Recrutement Post-doctoral position in microbial genomics

Post-doctoral position in microbial genomics

in La Reunion Island (France)

A 2-years post-doctoral position funded by the European Regional Development Fund (ERDF) is available for a highly motivated and talented young researcher in microbial genomics at the Research Unit Processus Infectieux en Milieu Insulaire Tropical (UMR PIMIT, INSERM U1187, CNRS 9192, IRD 249, Reunion University), Reunion Island, France.

The project “VECTOBIOMES : vector and microbiomes” aims at exploring the interplay between mosquitoes, associated microbiota and transmitted arboviruses. The main objective is to decipher the influence of the microbiota on the vector competence of Aedes mosquitoes to Chikungunya, Dengue and Zika viruses.

Bacteriomes and viromes hosted by Aedes species will be described through 16S amplicons and NGS sequences using mosquito natural populations sampled throughout Southwestern Indian Ocean Islands (i.e. Reunion, Mayotte, Seychelles, Comoros). The candidate will manage all comparative analyses of genomic data and will collaborate with colleagues working on the interference phenomenon observed during the tripartite interaction involving mosquito, its microbiota and transmitted arboviruses. Specifically, overlaying genomic data upon experimentally measured vector competence will allow highlighting candidate genes.

He/she should hold a PhD with strong expertise in NGS, bioinformatics and comparative analysis. Skills in genome assembly and annotation will be appreciated.

 


Additional information

Starting date : November 2018
Net salary : 2,500 € / month

Applicants should send a brief summary of research activities
a CV, a list of publications, and names and e-mail addresses of two references to :

Patrick Mavingui
patrick.mavingui@cnrs.fr
Phone : +262 (0)6 92 04 40 20 / +262 (0)2 62 21 25 70

Celestine Atyamé Nten
celestine.atyame-nten@univ-reunion.fr

Further information could be obtained from the same persons.
Deadline for submission July 15, 2018.

http://pimit.univ-reunion.fr

 

Lien pdf : Postdoc_Microbial_Genomics_PIMIT.pdf

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Offre de thèse Ecole Doctorale RP2E 410 – Université de Lorraine

Offre de thèse Ecole Doctorale RP2E 410 – Université de Lorraine

L’efficience d’utilisation de l’eau des arbres d’une chênaie conditionne-t-elle sa résilience à la sécheresse ?

Nous recherchons un (ou une) candidat(e) pour un projet de thèse démarrant à l’automne 2018 à l’INRA Centre Nancy-Grand Est, Champenoux (Ecole Doctorale RP2E 410 – Université de Lorraine).

Clôture des candidatures : 15 juin 2018.

  • Mots clés :

WUE, croissance, sécheresse, résilience, population, chêne, dendroécologie, forêt, changement climatique

  • Résumé.

L’augmentation de la sévérité et de la fréquence des déficits hydriques menace la productivité des peuplements forestiers à brève échéance. Identifier, pour une espèce, les populations ou les individus les plus résilients aux sécheresses pourrait permettre d’orienter la sylviculture. L’efficience d’utilisation de l’eau (WUE) semble être un trait particulièrement pertinent à évaluer puisqu’elle traduit le coût en consommation d’eau que représente le maintien d’un niveau donné d’assimilation carbonée. Pourtant, les liens existant entre WUE et résilience à la sécheresse, d’une part, ou WUE et productivité, d’autre part, sont encore largement incompris chez les arbres. Dans cette thèse, nous proposons de déterminer si le fait d’avoir une plus forte WUE procure réellement un avantage aux individus. Nous choisissons pour espèce d’étude le chêne sessile en raison de son importance écologique et économique et pour la somme de connaissances déjà assemblées. Pour atteindre notre objectif, nous mettrons en relation l’évolution, au cours de la vie des arbres, des variations de WUE et des trajectoires de croissance dans des populations écologiquement contrastées. Grâce à l’approche rétrospective retenue (dendroécologie), la relation entre WUE et croissance/résilience à la sécheresse pourra être examinée à court, moyen et long termes.

  • Co-Directeurs de thèse

– Oliver Brendel : oliver.brendel@inra.fr +33 3 83 39 41 00

– Stéphane Ponton : stephane.ponton@inra.fr +33 3 83 39 73 25

  • Lieu

Laboratoire d’accueil : UMR SILVA, INRA, Centre de Recherche de Nancy-Grand Est, 54280 CHAMPENOUX, FRANCE

  • Profil recherché :

– titulaire d’un master en écologie ou sciences de l’environnement, ou équivalent

– bon niveau en statistiques et goût pour l’analyse de données

– bonne aptitude au travail en équipe et attrait pour le travail de terrain

– excellente capacité rédactionnelle

– maîtrise de l’anglais (rédaction d’article scientifique, communication)

  • Candidature :

Une lettre de motivation, un CV, le relevé de note des M1 et M2 (ou des 3 années d’école d’ingénieur), deux lettres de recommandation, ainsi qu’une description synthétique (300 mots) du sujet de stage de M2 sont à adresser avant le 15 juin 2018 aux co-directeurs de thèse. Les candidats retenus seront auditionnés du 20 juin au 6 juillet 2018.

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Thesis Offer in wood quality

Thesis Offer in wood quality

Measuring wood quality of logs from low-cost sensors at the sawmill or at the road side

This PhD work will be realised in the framework of the PRCI ANR project TreeTrace, which is a bilateral research project involving France (funded by the ANR) and Austria (funded by the FWF) for a duration of three years 2018-2020.

Objective

One objective of this project is to develop image analysis tool, able to process rough log end images , in order to assist the expert at the sawmill for the grading of logs in the different quality classes. Such a tool could help small and medium-sized sawmills to become more competitive by using more accessible technologies than CT scanners.

Skills

The PhD candidate could be either a student in computer science very interested by wood, wood quality and wood industry, or a student in forest or wood sciences very motivated and interested in software programming and image analysis, and ready to invest massively in this discipline applied to the study of wood material.

Host laboratory

The PhD student will be mainly based in Nancy, North-East of France. The main location will be at INRA, centre Grand Est – Nancy, with the possibility to spend time at Loria (Université de Lorraine, UL), to discuss depending on the profile of the candidate.

Contacts

The PhD thesis will be co-supervised by Loria and AMPT.

•INRA/AgroParisTech : Fleur Longuetaud (fleur.longuetaud@inra.fr)

•Loria/UL, ADAGIo team : Isabelle Debled-Rennesson (Isabelle.Debled-Rennesson@loria.fr)

•AMPT : Robert Collet (robert.collet@ensam.eu)

Modalities to apply

The beginning of the PhD is planned for September 2018 but if a Master student would be interested to apply, it could eventually be possible to postpone the start of the PhD contract. Deadline for the application: 31/05/2018

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Offre de thèse gestion et changement climatique

Adaptation et développement d’un modèle écophysiologique / mécaniste simulant la gestion afin d’aider à l’adaptation des itinéraires sylvicoles au changement climatique

Cette thèse a reçu un co-financement Institut de Convergence CLAND et Office National des Forêts. Cette thèse doit débuter fin 2018 et se déroulera essentiellement sur le campus de l’Université de Paris-Sud Orsay.

  • Encadrement

Eric Dufrêne (DR CNRS) (directeur de thèse)
Christophe François (CR CNRS) (co-encadrant)
François Lebourgeois (Prof AgroParisTech) (co-encadrant)

  • Laboratoire d’accueil

Laboratoire Ecologie, Systématique, Evolution
(UMR 8079 CNRS / Université Paris-Sud / AgroParisTech)

  • Résumé

Dans un contexte climatique et économique non stationnaire, la gestion durable des ressources forestières apparait comme un enjeu majeur. L’état du développement des modèles à base écophysiologique couplés avec des modèles à base dendrométrique permet d’envisager leur utilisation pour mieux comprendre et prédire les interactions climat-gestion. Dans ce projet, il s’agit d’évaluer l’aptitude d’un tel modèle (i) à simuler la croissance dans des réseaux sylvicoles expérimentant des larges gradients de densité (croissance libre à autoéclaircie), (ii) d’utiliser le modèle pour définir / identifier des itinéraires sylvicoles susceptibles d’améliorer le compromis croissance résistance / résilience dans le but d’assurer une production soutenable du bois en forêt, (iii) d’utiliser le modèle comme outil de prédiction de la production de biomasse dans le cadre du changement climatique (scénarios climatiques couplés avec des scénarios de gestion). On traitera dans cette thèse principalement du cas du Chêne sessile, une ouverture étant proposée sur le Douglas.

  • Mots clés

Modèle couplé écophysiologique-dendrométrique, sécheresse, densité, changement climatique, production, Chêne sessile, Douglas, réseaux sylvicoles

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25/05/2018 conférence d’Alexandra Henocq

Alexandra Henocq
(IAM ecogenomic)

”Characterisation of the nutritional signals regulating the establishment and maintenance of ectomycorrhizal symbiosis (ECM) in Poplar”

 


Vendredi 25 mai 2018 à 13h30
INRA (LGEF)